Существуют как относительные противопоказания МРТ-диагностики, при которых проведение исследования возможно при определённых условиях, так и абсолютные, при которых исследование недопустимо.

 
Абсолютные противопоказания:
• установленный кардиостимулятор
• ферромагнитные или электронные имплантаты среднего уха
• металлические имплантаты, ферромагнитные осколки и стружки
• ферромагнитные аппараты Илизарова
 
Относительные противопоказания:
• инсулиновые насосы
• нервные стимуляторы
• неферромагнитные имплантаты внутреннего уха
• протезы клапанов сердца
• кровоостанавливающие клипсы (кроме сосудов мозга)
• декомпенсированная сердечная недостаточность
• первый триместр беременности
• клаустрофобия (панические приступы во время нахождения в тоннеле аппарата могут не позволить провести исследование)
• необходимость в физиологическом мониторинге
• тяжёлое/крайне тяжелое состояние пациента по основному/сопутствующему заболеванию.
 

Также МРТ противопоказана (или время обследования должно быть значительно сокращено) при наличии татуировок, выполненных с помощью красителей с содержанием металлических соединений. Исключение — наличие татуировок, выполненных с помощью красителей на основе соединений титана (например, на основе диоксида титана).

 

Широко используемый в протезировании титан и тантал не являются ферромагнетиками и практически безопасны при МРТ. Дополнительным противопоказанием для МРТ является наличие кохлеарных имплантатов — протезов внутреннего уха.